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瓜氨酸是一種α-氨基酸，因最 先從西瓜中獲取，而得名“瓜氨酸”。當瓜氨酸仍然是氨基酸時，由于它不是為DNA而編碼，所以是不會在蛋白質生物合成中嵌入蛋白質內，不過仍然有部份蛋白質含有瓜氨酸。這些瓜氨酸是由勝肽精胺酸亞氨酶（PAD）所產生，在瓜氨化的過程中將精氨酸轉化為瓜氨酸。一般含有瓜氨酸的蛋白質包括有人腦髓鞘堿性蛋白（MBP）、聚角蛋白微絲蛋白及一些組蛋白。如纖維素及波形蛋白能從細胞死亡及組織發炎中被瓜氨化。